Для визуализации больших графов, содержащих около 3000 вершин и 5000 рёбер, существует несколько программ и библиотек, которые могут помочь в этом. Вот некоторые из них:
1. **Gephi**: Это мощное ПО для визуализации и анализа графов. Оно поддерживает масштабируемость и интерактивность, позволяет выполнять фильтрацию и поиск по графу. Gephi хорошо подходит для анализа больших сетей и может работать с различными форматами данных.
2. **Cytoscape**: Это еще одно популярное приложение, которое предназначено для анализа и визуализации сложных сетевых данных. Оно имеет множество плагинов, которые могут расширить его функциональность.
3. **Graphviz**: Это библиотека для визуализации графов, которая может генерировать качественные графические представления. Однако она менее интерактивна по сравнению с Gephi или Cytoscape.
4. **D3.js**: Если вы хотите создать свою собственную веб-визуализацию, то D3.js — библиотека на JavaScript, которая позволяет создавать интерактивные графы и визуализации. Она требует некоторого навыка в программировании, но дает большую гибкость.
5. **Sigma.js**: Это еще одна JavaScript-библиотека, специально разработанная для визуализации графов в веб-приложениях. Она поддерживает масштабирование и может обрабатывать графы среднего размера.
6. **Neo4j с Bloom**: Если ваш граф хранится в базе данных Neo4j, то вы можете использовать инструмент визуализации Bloom для интерактивного поиска и визуализации графов.
7. **NetworkX & Matplotlib**: Если вы используете Python, то с помощью библиотеки NetworkX можно строить графы, а Matplotlib поможет визуализировать их. Однако для больших графов визуализация может быть менее интерактивной.
Каждое из этих решений имеет свои плюсы и минусы, поэтому выбор зависит от ваших конкретных требований и предпочтений. Попробуйте несколько из них, чтобы понять, какое ПО лучше всего подходит под ваши задачи.