Некорректная работа swiper может быть вызвана неправильными настройками слайдера, ошибками в коде, конфликтами с другими скриптами на странице, неправильной структурой HTML элементов, или проблемами с загрузкой данных для слайдов.
Для настройки swiper таким образом, чтобы отображались только 12 слайдов по 4 элемента в 3 столбца на одном слайде, вы можете использовать опции slidesPerView и slidesPerColumn вместе с параметром spaceBetween для задания отступов между элементами. Вот пример настройки слайдера:
```javascript
var swiper = new Swiper('.swiper-container', {
slidesPerView: 4,
slidesPerColumn: 3,
spaceBetween: 10,
// остальные настройки слайдера
});
```
Таким образом, на каждом слайде будет отображаться 12 элементов (4 строки по 3 элемента в каждой), остальные элементы будут перемещены на следующие слайды автоматически. Необходимо учитывать, что заполнение слайдов до конца может зависеть от стилей и контента элементов на слайде.