Правило "RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d" создает более значительную нагрузку на сервер, по сравнению с правилом "RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f". Это связано с тем, что проверка на существование директории (по правилу !-d) требует больше ресурсов, чем проверка на существование файла (по правилу !-f).
Добавление правил RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f и RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d во втором варианте конфигурации htaccess приведет к тому, что сервер будет проверять существование как файла, так и директории перед применением соответствующего правила RewriteRule. Это может повысить нагрузку на сервер из-за дополнительных проверок, особенно если на сервере много запросов к файлам и директориям. Однако, в целом, влияние этих правил будет не слишком значительным и может быть относительно незаметным для большинства ситуаций использования.