Как изменить настройки фильтрации в электронной таблице так, чтобы новые строки на сводном листе отображались внизу списка?

Для изменения настроек фильтрации в электронной таблице так, чтобы новые строки на сводном листе отображались внизу списка, нужно открыть сводный лист, нажать на стрелку возле имени столбца, по которому производится фильтрация, и выбрать "Сортировка данных" -> "Настроить сортировку". Затем выбрать необходимый способ сортировки (например, "Сначала новые") и нажать "Применить".

Что касается изменения формулы FILTER в Google Sheets, чтобы данные из листа1 отображались в конце сводного листа, можно добавить условие в формулу FILTER, чтобы данные из листа1 были отфильтрованы в конце списка. Например, если данные из листа1 отображаются в столбце A, можно добавить условие "<>"" в формулу, чтобы отфильтровать пустые ячейки в конце списка. 

Пример формулы с условием:
=FILTER('Лист1'!A:A, 'Лист1'!A:A<>"") 

Таким образом, новые данные из листа1 будут отображаться после всех строк из листа1, листа2 и листа3 на сводном листе.

Логично, что она будет между, потому что у тебя свободная таблица формируется из лист1+лист2+лист3 друг за другом. 
 Я думаю, варианта 2, хотя не уверен, давно сводные не открывал. 
 1) Добавить ещё один столбец с датой / порядковым номером и сводную сортировать. 
 2) Добавить столбец и через GAS сделать автоматическое копирование данных на твою таблицу (данные столбца будешь использовать для сортировки и синхронизации других отредактированных ячеек).