Если на вашем сайте реализован редирект с без www на www версию, то поисковые системы обычно учитывают и учитывают внешние ссылки без префикса www, так как они автоматически переадресуются на www версию сайта. Однако, для улучшения процесса индексации и ранжирования вашего сайта, рекомендуется использовать единый вариант URL (с www или без www) для всех внутренних и внешних ссылок.
Чтобы учесть внешние ссылки с других сайтов на вашем сайте, можно использовать инструменты аналитики, такие как Google Search Console, чтобы отслеживать количество и качество внешних ссылок на оба варианта URL. Также можно рассмотреть возможность создания канонического тега на основной версии URL, чтобы указать поисковым системам предпочтительную версию сайта.
Если у вас уже есть много внешних ссылок на оба варианта URL и изменить их не представляется возможным, то лучшим способом решения этой проблемы будет использование редиректов с версии без www на версию с www. Таким образом, все пользователи и поисковые системы будут автоматически перенаправлены на основное зеркало сайта. Необходимо также проверить правильность настройки серверов, чтобы редиректы работали корректно.
В целом, наилучшим способом решения данной проблемы будет использование единого варианта URL для всех ссылок и настройка редиректов для обеспечения единой версии сайта.