Это может быть связано с тем, что в вашем коде была добавлена функция обработки нажатия клавиши ENTER, которую auto-py-to-exe не смог правильно обработать при конвертации кода в EXE файл.
Для исправления этой проблемы, вам нужно проверить ваш исходный код и убедиться, что вы не добавили ненужные обработчики нажатия клавиш, особенно для клавиши ENTER. При конвертации кода с GUI через auto-py-to-exe, такие обработчики могут вызывать нежелательные действия, например, автоматическое нажатие клавиши ENTER.
Если проблема остается, вам также стоит обратить внимание на другие возможные конфликты или ошибки в вашем исходном коде, которые могли привести к данной проблеме. Рекомендуется внимательно изучить и отладить свой код перед конвертацией в EXE файл, чтобы избежать подобных непредвиденных ситуаций.