Как можно скопировать настройки прав пользователей, такие как выбранные флажки, из Конфигуратора на другие учетные записи?

Для этого можно воспользоваться функционалом Конфигуратора 1С. Вот шаги, которые можно выполнить:

1. Откройте Конфигуратор и найдите объект "Права доступа пользователей".

2. Найдите пользователя, у которого уже заданы необходимые настройки прав доступа.

3. Скопируйте эти настройки в буфер обмена, нажав на кнопку копирования или используя комбинацию клавиш Ctrl+C.

4. Затем найдите других менеджеров, к которым вы хотите применить эти настройки.

5. Вставьте скопированные настройки из буфера обмена на их учетные записи, нажав на кнопку вставки или используя комбинацию клавиш Ctrl+V.

Теперь у выбранных менеджеров будут такие же настройки прав доступа, как и у пользователя, у которого вы скопировали настройки.

Все ваших руках и познания код 1С ) 
 Так подобное было распространено на старых конфигурациях УПП/УТ. Роль задавались в конфигураторе. И были под это специальные обработки 
 Сча (новых) это раздается несколько сложней составления нужных ролей но легче из раздаче. Ну замогоченей в плане создания обработок. 
 поисковив к помошь)

Возможно для вас такая постановка вопроса выглядит полной, но для людей, которые с вами не знакомы, тут полный хаос: 
 
 1) Начать нужно с четкого названия программного продукта. В 7.7 была своя кухня, потом на 8.0/8.1 в основанных на УПП продуктах права чуть переработали. Потом на управляемых приложениях 8.2/8.3 права сильно переработали - настолько, что концепции полностью различны в УНФ,  ДО и основанных на ERP-продуктах. 
 
 2) Не хватает названий справочников, регистров и т.д. с которыми вы работаете , а используемые термины вводят в заблуждение. С одной стороны во всех современных системах в конфигураторе делают только атомарные роли (например пару ролей "Чтение Контрагентов" и "Изменение Контрагентов" - первая только для чтение одного указанного справочника, а вторая позволяет добавлять новые и изменять существующие), а уже в настройках продукта есть справочник "Профиль прав пользователя" или "Профиль прав группы пользователей", которые называют "Менеджер" и в который накидывают список атомарных ролей. С другой стороны еще недавно роли именно так и назывались - "Менеджер" и все доступы давали сразу в конфигураторе. Если вы настроили справочный профиль "Менеджер", то назначайте его всем требуемым пользователям в режиме "Предприятие", а если вы сделали роль "Менеджер", то назначайте его всем требуемым пользователям в режиме "Конфигуратор". 
 
 3) Использование выдуманных терминов , которые не используются в методологии большинства известных продуктов 1С - "выборочные настройки прав Пользователя" и "флажки прав". Лучше использовать термины из документации к вашему программному продукту. Если документация отсутствует, то по надписям в интерфейсе. Иначе хотя бы скриншоты.