Для удаления всех префиксов в CSS коде можно воспользоваться такими инструментами, как Autoprefixer или PostCSS. Эти инструменты могут автоматически добавлять и удалять вендорные префиксы в CSS коде.
Чтобы упростить файл Bootstrap и удалить лишние префиксы, можно использовать готовые инструменты для оптимизации CSS кода, например, PurifyCSS или CSSNano. Эти инструменты позволяют удалить неиспользуемый CSS код, включая лишние префиксы, и сделать файл более легким и читаемым.
Таким образом, существуют инструменты, которые могут помочь упростить CSS код и удалить все дополнительные префиксы из файла Bootstrap.