Для начала, рекомендую вам проверить логи ошибок на PythonAnywhere, они могут содержать информацию о том, почему ваш бот перестает правильно обрабатывать команды.
Также, возможно, проблема связана с тем, что на PythonAnywhere используется другая версия Python или другие библиотеки, чем на вашем локальном компьютере. Убедитесь, что версии Python и необходимые библиотеки установлены на PythonAnywhere.
Для детального анализа ошибок и отладки кода на PythonAnywhere, вы можете воспользоваться инструментами для логирования и отладки кода, такими как `logging` модуль или `pdb` (Python Debugger).
Если у вас есть доступ к консоли PythonAnywhere, попробуйте запустить свой бот напрямую из консоли и пошагово отслеживать выполнение кода, чтобы выявить место, где возникает ошибка.
Также, рекомендую обратить внимание на возможные проблемы с сетевым доступом и настройками безопасности на PythonAnywhere, которые могут повлиять на работу вашего бота.
Надеюсь, эти советы помогут вам найти и исправить проблему с выполнением команд вашего Telegram бота на PythonAnywhere. Если у вас будут дополнительные вопросы или нужна дополнительная помощь, не стесняйтесь обращаться за дополнительной поддержкой.