Для управления игрой в Nestopia через программу AutoHotkey можно использовать специальные скрипты, которые могут эмулировать нажатия клавиш клавиатуры или действий мыши. Например, чтобы отправить команду на кнопку "A", можно использовать следующий скрипт:
```
#NoEnv
SendMode Input
SetKeyDelay, 0
Loop
{
IfWinExist, Nestopia
{
WinActivate
Send, {A down}
Sleep, 100
Send, {A up}
Sleep, 100
}
}
```
Этот скрипт будет отправлять нажатие на кнопку "A" каждые 100 миллисекунд, если окно Nestopia активно.
Также можно попробовать использовать специальные библиотеки для эмуляции ввода, например, `WinAPI` или `SendInput`, но это может потребовать более сложного программирования и понимания работы с драйверами.
Более простой способ управления игрой - это использование контроллера или джойстика, который поддерживается эмулятором Nestopia. Многие игровые контроллеры можно легко настроить и использовать для управления игрой в Nestopia.