Для компиляции JavaFX приложения из jar файла в исполняемый файл .exe можно воспользоваться инструментом Launch4j. Необходимо создать XML-файл конфигурации, указав путь к jar файлу, классу Main, а также другие параметры. После этого запустить процесс компиляции, который создаст исполняемый файл .exe.
Если при создании exe с помощью Launch4j возникает проблема с запуском без выдаваемых ошибок, это может быть связано с различными причинами, например неправильно указанными путями к файлам или зависимостями, отсутствием необходимых библиотек и т.д. Рекомендуется проверить правильность всех настроек, путей к файлам, наличие необходимых зависимостей и так далее. Также можно попробовать запустить exe файл с помощью командной строки, чтобы увидеть возможные ошибки, которые не выводятся при запуске через интерфейс.