Для редактирования файла setup.exe можно использовать специализированные программы, такие как Resource Hacker, PE Explorer, или любой другой ресурсный редактор, способный работать с исполняемыми файлами.
Файл setup.exe игры S.T.A.L.K.E.R.: Зов Припяти v1.6.00 скорее всего написан на языке программирования C++ или C#. Для его редактирования можно использовать программу, которая поддерживает работу с исполняемыми файлами, например Resource Hacker или PE Explorer, а также специализированные инструменты для дизассемблирования и анализа исполняемых файлов.