Могут быть несколько причин, почему всплывающее окно (popup) не закрывается после нажатия кнопки "Принять":
1. Отсутствие корректного кода закрытия окна после нажатия кнопки "Принять". Убедитесь, что после нажатия кнопки "Принять" выполняется соответствующий скрипт закрытия всплывающего окна.
2. Наличие ошибок в коде JavaScript или jQuery, отвечающем за закрытие всплывающего окна. Проверьте консоль разработчика на наличие ошибок при выполнении скрипта.
3. Возможно, что при переходе между страницами сайта не происходит перезагрузка страницы полностью, и окно cookie сохраняется в локальном хранилище браузера. В этом случае, необходимо добавить проверку наличия выбора cookie при загрузке каждой страницы и закрывать окно соответственно.
Приведенного вами куска кода недостаточно для полной оценки ситуации, поэтому рекомендуется более детально изучить всю логику работы с всплывающим окном и кодом JavaScript, отвечающем за его работу.