Для обработки URL-кодированных слов в кодировке windows-1251 на вашем сайте, вам необходимо установить соответствующую кодировку в настройках сервера или в скрипте обработки запросов.
В случае использования PHP, вы можете использовать функцию mb_convert_encoding() для конвертации URL из windows-1251 в UTF-8 перед их обработкой.
Пример:
```php
$url = 'закодированный_url_windows-1251';
$url = mb_convert_encoding($url, 'UTF-8', 'windows-1251');
```
Чтобы управлять взаимодействием с ботом YandexBot/3.0, учитывая его User-Agent в запросах, вы можете использовать файл robots.txt для указания правил индексации URL. В файле robots.txt вы можете добавить следующие строки:
```
User-agent: YandexBot
Disallow: /путь_к_запрещенной_странице
```
Таким образом, вы можете запретить боту YandexBot/3.0 индексацию определенных страниц на вашем сайте.
Не забудьте также проверить, что ваш сайт правильно устанавливает заголовок Content-Type в ответах сервера, чтобы указать правильную кодировку страницы.