Есть два режиме загрузки, старый mbr legacy, который будет работать и с dos разделами (dos тут то самое название операционной системы из 80-90-ых, это чтобы понимать с каким старьем имеешь дело, как минимум там проблемы с дисками больше 2тб) и с gpt и 'новый' - efi, который требует чтобы разделы были типа gpt (если у тебя есть понятие логический раздел - то у тебя dos).
Если используешь legacy mbr - настоятельно рекомендую сначала установить windows, а затем настроить загрузку grub linux, причем желательно с другого устройства (речь идет только о загрузчике grub, для которого требуется 1 мб места, причем это может быть хоть флешка или карта памяти, и даже cdrom или загрузка по сети pxe), в этом случае никаких проблем и конфликтов не будет. Существует способ установить оба загрузчика на один физический диск (grub умеет запускать windows) но сам windows может по своей прихоти (это было и не раз) тупо удалять загрузчик linux и перенастраивать все на себя.
Если используется efi - в этом случае раздел efi boot может быть общим как для linux так и для windows, мало того есть возможность настроить efi загрузку прямо средствами биоса, прописав месторасположение ядра и initramfs linux прямо там (т.е. не нужно загрузочную область создавать, но она и так и так нужна для windows). Опять тут рекомендуется сначала настроить windows, а затем вручную прописать с помощью efiboot утилит в linux как грузиться. Обычно штатный установщик с gui это не сделает, хотя я давно не смотрел... Я привык что чтобы не было проблем от windows, лучше посадить ее на отдельное устройство и никак не давать ей ломать что то в linux.
Чтобы в legacy boot можно было загрузиться с gpt диска, нужно на нем создавать 1мб bios boot раздел (туда будет установлен загрузчик grub), в dos же разделах эта область уже есть по умолчанию в начале диска.
Настоятельно рекомендую сделать резервную копию всего диска, не жалейте денег и времени на это, потом себя вспомните хорошим словом.