Чтобы предотвратить автоматическое создание папки .idea при открытии пустой папки в PhpStorm, можно выполнить следующие шаги:
1. Откройте PhpStorm и перейдите в меню "File" (Файл).
2. Выберите "Settings" (Настройки).
3. В открывшемся окне настройки выберите "Editor" (Редактор) и затем "File and Code Templates" (Шаблоны файлов и кода).
4. Найдите шаблон файла "Project files" (Файлы проекта) и убедитесь, что в разделе "Include" (Включить) нет строки ".idea/".
5. Если строка ".idea/" присутствует, удалите ее и сохраните изменения.
После этого при открытии пустой папки в PhpStorm папка .idea не будет автоматически создаваться.