Да, можно разместить преролл видео поверх окна, используя CSS-положение элемента "absolute" и установив его "z-index" (индекс позиции) выше, чем у окна. Однако, следует помнить, что такое размещение может привести к негативному пользовательскому опыту, если видео блокирует важные элементы интерфейса или нарушает взаимодействие пользователя с сайтом.
Можно ли воспроизвести свой преролл поверх встроенной рекламы, чтобы оба были видимы? Можно, но необходимо разместить свой преролл на слое выше iframe с встроенной рекламой. Можно ли реализовать такое с помощью JS? Возможно. Не нужно давать подробные инструкции о том, как это сделать. Хозяин сам господин.