Для обновления сертификата в Bitrix VM можно выполнить следующие шаги:
1. Скопируйте новый сертификат и закрытый ключ на сервер вместе с цепочкой сертификатов (если есть).
2. Откройте файл конфигурации nginx, который обычно находится в `/etc/nginx/nginx.conf`, и убедитесь, что путь до нового сертификата и закрытого ключа указан верно. Необходимо проверить следующие строки:
```
ssl_certificate /путь/до/сертификата.crt;
ssl_certificate_key /путь/до/закрытого/ключа.key;
```
3. Проверьте, что nginx успешно загрузил новые сертификаты и не содержит ошибок в конфигурации, выполнив следующую команду:
```
sudo nginx -t
```
Если при проверке возникают ошибки, устраните их, изменив конфигурационный файл.
4. Перезапустите nginx, чтобы применить новые сертификаты:
```
sudo service nginx restart
```
После перезапуска nginx новый сертификат будет применен.