Существует возможность сравнить и вывести список файлов, разных только по содержанию, без необходимости загружать обе директории на локальную машину.
Вы можете использовать утилиту rsync для сравнения двух директорий удаленных серверов по содержимому файлов. Воспользуйтесь следующей командой ssh для сравнения двух директорий на удаленных серверах и вывода списка файлов, отличающихся только по содержанию:
ssh user@server1 'rsync -avn --delete <server2>:<directory> <directory> > diff_files.txt'
В данной команде замените user на имя пользователя, server1 и server2 на адреса удаленных серверов, а <directory> на путь к целевой директории, содержимое которой вы хотите сравнить.
После выполнения команды будет создан файл diff_files.txt, содержащий список всех файлов, различающихся только по содержанию, без учета даты.