Возможно, причина заключается в том, что редактор тем в WordPress может отображать только основной содержимый файлов темы, а не все элементы, которые могут быть встроены в шаблоны страниц.
Когда вы открываете файл темы в редакторе, вы видите только основной HTML-код, а не те элементы, которые могут быть добавлены динамически с использованием функций PHP или с использованием плагинов. В таких случаях, хотя в редакторе вы и не видите эти элементы, они все равно будут отображаться на вашем сайте.
Также, возможно, различия между header, который виден на вашем сайте, и тем, который отображается в редакторе, могут связаны с темой, которую вы используете. Некоторые темы могут иметь свои собственные методы для настройки header или других элементов сайта, которые не отображаются в редакторе тем.
Если вам необходимо изменить header или другие элементы сайта, вам может потребоваться искать в файлах темы или использовать специальные плагины, которые позволяют настраивать элементы дизайна без изменения кода напрямую.