Изменение уникальных идентификаторов в базах данных 1С может быть вызвано несколькими причинами:
1. Виртуальная машина была склонирована или создан новый экземпляр виртуальной машины. В этом случае уникальные идентификаторы баз данных могут измениться, так как они связаны с конкретным экземпляром виртуальной машины.
2. При обновлении платформы 1С могли быть внесены изменения в формат баз данных, что также может привести к изменению уникальных идентификаторов.
3. Возможно, были выполнены какие-то конфигурационные изменения, в результате которых уникальные идентификаторы изменились.
Что касается проблемы с одинаковыми уникальными идентификаторами после перезагрузки сервера, возможно, что это связано с ошибкой или неожиданным поведением платформы 1С. Чтобы точно определить причину проблемы, рекомендуется обратиться в службу поддержки 1С или проконсультироваться с опытными специалистами по 1С. Они смогут провести более подробный анализ и дать рекомендации по устранению этой проблемы.