Почему фильтр в корне комплектного каталога (в файле sections.php) может не функционировать?

Возможно, проблема заключается в том, что комплектный каталог не содержит нужные данные для работы умного фильтра. Умный фильтр основан на свойствах товаров, поэтому для его работы необходимо, чтобы у товаров были заданы соответствующие свойства.
Если у вас в корне каталога выводятся все товары без какой-либо фильтрации, то скорее всего эти товары не содержат нужных свойств для работы умного фильтра.

Если у вас есть разделы в каталоге, и фильтрация в них работает исправно, то возможно в этих разделах у товаров уже заданы соответствующие свойства.

Чтобы умный фильтр работал в корне каталога, вам необходимо для каждого товара в корне задать нужные свойства.

$APPLICATION->IncludeComponent(
    "bitrix:catalog.smart.filter",
    "",
    array(
        "IBLOCK_TYPE" => $arParams["IBLOCK_TYPE"],
        "IBLOCK_ID" => $arParams["IBLOCK_ID"],
        "SECTION_ID" => $arCurSection['ID'],
        "FILTER_NAME" => $arParams["FILTER_NAME"],
        "PRICE_CODE" => $arParams["~PRICE_CODE"],
        "CACHE_TYPE" => $arParams["CACHE_TYPE"],
        "CACHE_TIME" => $arParams["CACHE_TIME"],
        "CACHE_GROUPS" => $arParams["CACHE_GROUPS"],
        "SAVE_IN_SESSION" => "N",
        "FILTER_VIEW_MODE" => $arParams["FILTER_VIEW_MODE"],
        "XML_EXPORT" => "N",
        "SECTION_TITLE" => "NAME",
        "SECTION_DESCRIPTION" => "DESCRIPTION",
        'HIDE_NOT_AVAILABLE' => $arParams["HIDE_NOT_AVAILABLE"],
        "TEMPLATE_THEME" => $arParams["TEMPLATE_THEME"],
        'CONVERT_CURRENCY' => $arParams['CONVERT_CURRENCY'],
        'CURRENCY_ID' => $arParams['CURRENCY_ID'],
        "SEF_MODE" => $arParams["SEF_MODE"],
        "SEF_RULE" => $arResult["FOLDER"].$arResult["URL_TEMPLATES"]["smart_filter"],
        "SMART_FILTER_PATH" => $arResult["VARIABLES"]["SMART_FILTER_PATH"],
        "PAGER_PARAMS_NAME" => $arParams["PAGER_PARAMS_NAME"],
        "INSTANT_RELOAD" => $arParams["INSTANT_RELOAD"],
    ),
    $component,
    array('HIDE_ICONS' => 'Y')
);