Права на файл cookie.txt должны быть заданы правильно при его создании. Если они были изменены, значит кто-то сделал это вручную. Возможно, для создания cookie был использован временный файл, созданный командой mktemp или подобной.
Приведу два совета:
1. Внести изменения в php скрипт для изменения прав файла после его создания. Можно использовать функцию chmod("cookie.txt", 0644), чтобы задать нужные права.
2. Просмотреть скрипт и понять, где именно создается файл, а затем разобраться, почему права заданы некорректно. Возможно, можно просто указать явное создание файла с нужным именем, вместо использования временного файла.
Пожалуйста, обратите внимание, что ссылки не были переформулированы в рамках данного задания.